На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский

СПИД-диссидентская тема

В свете происходящего на форуме Первого канала решила, что такая тема нам необходима.
Итак.
Зачем эта тема нужна?
Затем, что, если вам, вашим знакомым или просто на просторах инета попадётся на пути СПИД-диссидент, у вас будет выбор, куда его послать - туда, куда обычно, или в эту тему
Если у кого-то появятся вопросы, касающиеся теоретических изысканий и практических аспектов, пишите, будем искать ответы

30 апр. 2010 г. в 22:06
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Никто и никогда не видел ВИЧ. Нет ни одной фотографии ВИЧ. 
Ответ 1. Этот аргумент противоречит всей истории исследования ВИЧ и СПИДа. ВИЧ был открыт в 1983. В том же 1983 было показано, что добавление ВИЧ в культуру CD4 лимфоцитов приводило к гибели этих клеток in vitro . В 1984 обнаружены антитела к ВИЧ а сам вирус удалось клонировать .
В 1985 секвенирован геном ВИЧ Однако, как позднее свидетельствовал сам Роберт Галло:«Мы так и не нашли ВИЧ в Т-лимфоцитах» (New York Native, 13 июня 1994 г.). Кроме того, доктор Элени Пападопулос-Элиопулос указала на серьёзные погрешности при выявлении ретровируса. В журнале «Континуум» она заявила, что электронные микрофотоснимки ретровируса являются фотографиями неочищенных клеточных культур, что представляет собой грубое нарушение норм выявления ретровирусов (рассматриваемых только в градиенте плотности). В 1986 открыт родственный вирус, получивший название ВИЧ-2 . К середине 90-х годов были открыты родственные ВИЧ вирусы у животных, и подробно изучен цикл жизни ВИЧ. Кроме того, в 90-х годах путём объединения частей генома ВИЧ и родственных ему вирусов удалось создать несколько линий химерных вирусов . К 2000 году созданы детальные трёхмерные модели основных белков ВИЧ. Наконец в 2002 нескольким учёным, использовавшим новые способы окрашивания, удалось заснять перемещение ВИЧ в цитоплазме инфицированной клетки и его продвижение к ядру . Кроме того, в 2009 году с помощью 3D видеомикроскопии был детально изучен процесс распространения флуоресцентных клонов ВИЧ в популяции Т-лимфоцитов.
В свете этих достижений необходимость выделения ВИЧ по стандартизованной технологии 70-х годов XX века, на которой настаивают Елена Пападопулос-Елеопулос и некоторые другие диссиденты, неочевидна.
Следует отметить, что большинство диссидентов признают выделение и существование ВИЧ.
 Ответ 2.  Окрашенный вирус: www.youtube.com/watch?v=1wTCYnWYsCQ
Съемка вируса электронным микроскопом: http://www.youtube.com/watch?v=OeWHYXzOzoA&feature=related
 Ответ 3.  https://www.msu.edu/~luckie/paris/290B/Montagnier.pdf Там есть фотографии вирусных частиц.
Ответ 4. Cryo-Electron Tomographic Structure of an Immunodeficiency Virus Envelope Complex In Situ
Giulia Zanetti, John A. G Briggs,Kay Grьnewald, Quentin J Sattentau and Stephen D Fuller
 PS Да-да, эта самая мелюзговая хрень - он и есть 

30 апр. 2010 г. в 22:26
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Монтанье публично признался, что ни ему, ни группе Галло так и не удалось выделить вирус ВИЧ. Люк Монтанье в одном из своих интервью сказал следующее: возможно это был не ВИЧ, а какой-то другой ретровирус. Наша группа не очищала ВИЧ. И я не знаю, очищал ли ВИЧ Галло. Я так не думаю. 
Возможно, в 80х годах он и сомневался, но в интервью нашего времени он вполне уверен, что ВИЧ существует. Интервью с Люком Монтанье ниже.

ЛЮК МОНТАНЬЕ: УКРЕПЛЕНИЕ ИММУННОЙ ЗАЩИТЫ ОРГАНИЗМА
«Курьер Юнеско»

Двадцать лет назад англичанин Джон Р. Вэйн, лауреат Нобелевской премии по медицине, выступил в Курьере, подчеркивая важную роль международного сотрудничества в борьбе со СПИДом. В наши дни Люк Монтанье — один из наиболее известных сторонников развития этого сотрудничества — рассказывает в интервью с Ясминой Шоповой о средствах борьбы с пандемией, приведшей к гибели во всем мире более 25 миллионов людей.
— Всемирному фонду исследований и профилактики СПИДа, созданному вами под эгидой ЮНЕСКО, исполнилось 15 лет. Каковы цели его работы и достигнутые результаты?
— Задачей Фонда является развитие исследований и профилактика СПИДа, в частности, в развивающихся странах, наиболее затронутых этой болезнью. Он был создан на базе ведущих центров, которые следуют тройственной стратегии, включающей, наряду с научными исследованиями, профилактику и образование в области ВИЧ и СПИДа.
Так, в 1996 году был создан Исследовательский центр в Кот дИвуар, разумеется, с согласия и при помощи правительства этой страны в то время. Затем мы получили поддержку последующих правительств. Центр расположен в столице Абиджане, но его отделения работают и в других городах Кот дИвуар.
Вначале мы оборудовали просто лабораторию по выявлению вируса. Сегодня же Центру предоставлено новое здание, где одновременно проводятся диагностика и амбулаторное лечение пациентов. В нем есть конференц-зал, где организуются мероприятия по образованию и профилактике. Здесь же ведется подготовка персонала, в задачу которого входит просвещение населения по вопросам профилактики СПИДа на предприятиях. Например, большинство учреждений, работников которых в Африке называются «люди в униформе» (армия, полиция, пожарная служба, таможня, лесное хозяйство...), направили в наш Центр своих представителей на курсы подготовки.
— Не так давно вы открыли еще один Центр — в Камеруне. Между тем, под данным ЮНЭЙДС, самых драматических масштабов эпидемия достигла в южной Африке.
— Даже если показатели по СПИДу в Западной Африке менее тревожные, чем на юге континента, они все же намного выше того, что мы наблюдаем в промышленно развитых странах. Уровень заражённости в Кот дИвуар в настоящее время порядка 5,7%. И это достаточно высокий показатель.
Несколько лет назад мы изучали возможность открытия Центра в Южноафриканской республике. Но в то время власти этой страны не были уверены, что найденный нами вирус является причиной СПИДа, и не оказали нам необходимой поддержки. В Конго, Габоне и Танзании главы государств проявили свою заинтересованность, но там пришлось столкнуться с проблемами финансового порядка.
Следует отметить, что Фонд может работать только при поддержке государства, которое предоставляет либо помещение, либо субсидии. Так, Центр в Камеруне финансируется правительством и за счет средств, поступающих от развитых стран, например, Италии. Кроме того, я хочу сказать, что правительство Камеруна прилагает особые усилия для просвещения молодежи. Во время посещения школ я был удивлен, насколько полными знаниями о СПИДе обладали дети в возрасте 8 -10 лет.
Центр в Абиджане частично работает за счет собственных средств. Его посещает огромное количество людей. Те, кто может платить, платят за консультации и лечение, а тем, кто не может, лечение зачастую предоставляется бесплатно благодаря государственной политике и помощи Глобального фонда по борьбе со СПИДом, туберкулезом и малярией.
— Приходится ли вам сталкиваться с проблемами культурного характера?
— В Африке есть свои специфические проблемы. Поэтому крайне важно учитывать аспекты местной культуры. Ряд местных традиций способствует передаче вируса, например, ритуальные надрезы на коже у новорожденных или же практика использования нестерильных инструментов при родах.
Нередко случается так, что женщина приходит в роддом совершенно здоровой, а выходит уже вирусоносителем из-за несоблюдения гигиенических норм, главным образом, использования нестерилизованного медицинского материала. Главная тому причина — недостаток финансовых средств, но недостаток знаний также имеет место. Бывают также случаи, когда новорожденные заражаются от молока кормилицы, которой работающие матери доверяют своих детей.
Кроме того, большое количество людей не хочет делать анализы, опасаясь общественного осуждения в случае позитивного результата. Наша роль заключается в том, чтобы убедить их в необходимости анализов для того, чтобы мы могли предоставить им лечение. Но бывает и так, что уже в процессе лечения пациенты, почувствовав себя чуть лучше, бросают пить лекарства по финансовым причинам. В результате болезнь возвращается.
— Сотрудничаете ли вы с традиционными лекарями?
Такое сотрудничество вполне допустимо. Между тем, нам не просто проверить, какие снадобья они используют, потому что рецепты их изготовления, передаваемые из поколения в поколение, держатся в секрете. И поскольку эти лекарства невозможно запантентовать, то они не интересны фармацевтической промышленности.
В нашем Центре в Абиджане мы протестировали одно привезенное из Японии лекарство, изготовленное на основе забродившей мякоти папайя. Японцы держат в секрете его изготовление, но речь идет о лекарстве с четкой фармацевтической формулой, прошедшем контрольное клиническое тестирование. Каждая его доза идентична предыдущей, чего мы не можем сказать о настойках из растений.
Опыты показали, что это лекарство, конечно, не может заменить тритерапию, но что оно оказывает заметное положительное влияние на укрепление иммунной системы пациентов. Мы уже провели второе клиническое исследование и в настоящее время ожидаем его результаты.
Мы тестируем также и другие иммунные стимуляторы. Для того, чтобы терапевтическая вакцина, над которой мы сейчас работаем, дала свои результаты, иммунная система пациента должна быть восстановлена. То есть нельзя ограничиться одной тритерапией.
— Вы считаете, что избавления от СПИДа можно добиться при помощи терапевтической вакцины. Вы уже писали об этом в 2000 году в журнале «Источники ЮНЕСКО». На какой стадии исследований вы находитесь сегодня?
— Если говорить о концепции, то, действительно, ей уже десятки лет. Вначале идея терапевтической вакцины была плохо принята финансовыми учреждениями, французскими и международными. Она не нашла сторонников, поскольку тогда надеялись изготовить профилактическую вакцину и думали, что будет найдено лечение до полного выздоровления.
С тех пор многое изменилось. Сегодня мы знаем, что терапия не вылечивает и что пожизненное лечение вызывает побочные токсические эффекты и даже нередко приводит к другим смертельным заболеваниям.
Сегодня проект терапевтической вакцины, можно сказать, созрел и имеет более благоприятные перспективы, потому что на него выделены частные финансовые средства.
— Вы верите в то, что Нобелевская премия поможет вам получить дополнительное финансирование?
— Я надеюсь! Таков мой краткий и четкий ответ.
— Каковы преимущества терапевтической вакцины?
— Сама природа дает нам примеры людей, которые являются носителями ВИЧ, но при этом не больны СПИДом. Мы ведем исследования по поиску вакцины, которая укрепляет иммунитет зараженного организма, давая ему силы для самозащиты. Таким образом, человек сможет жить, никогда не заболев.
В финансовом плане, следует напомнить, лечение одного человека сегодня стоит 12 тысяч долларов в год, и оно может тянуться 20, 30 лет... Вакцина же, требует трех прививок: две последовательно и еще одна через год. Это классический метод. И какова бы ни была стоимость этой вакцины, ее использование обойдется в 20-50 раз дешевле, чем лечение.
— А что касается излечения от СПИДа?
— Вылечить человека от СПИДа и избавиться от эпидемии — две разные вещи. Вылечить — это наша ближайшая цель, что, конечно, окажет значительное влияние на эпидемию в целом. Когда люди узнают, что от СПИДа можно вылечиться, то они более охотно решатся на анализы, а выздоровевшие уже не станут источником заражения вирусом.
Но не стоит думать, что это каким-то чудесным образом случится достаточно скоро. В ближайшее время мы не можем рассчитывать на создание профилактической вакцины. Лично я не верю в возможность профилактической прививки в случае СПИДа. Клинические опыты показали, что группа людей, которым были сделаны прививки, еще быстрее заражалась вирусом СПИДа, поскольку все они думали, что их предохранит введенная вакцина, а она оказывалась неэффективной.
Искоренение СПИДа может быть достигнуто только при комбинации лечения, которое приводит к выздоровлению, информации и образования по ВИЧ и СПИДу, в том числе среди молодежи в школах. Даже если нами будет создана профилактическая вакцина, надо будет по-прежнему постоянно просвещать население о необходимости вести ответственный образ жизни, чтобы предотвратить передачу ВИЧ.

30 апр. 2010 г. в 22:29
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Даже по официальным данным риск передачи ВИЧ половым путем меньше 0,01%. То есть чтобы заразиться ВИЧ половым путем, нужно вступать в незащищенные контакты с ВИЧ+ 10 000 раз. Значит, передача невозможна.
Подсчет в корне неверен. Данная вероятность говорит, что в случае 10 000 ВИЧ+ людей, имеющих одномоментно секс с 10 000 ВИЧ- людей, один из этих 10 000 ВИЧ- людей заразится.

30 апр. 2010 г. в 22:31
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Почему СПИД бывает у тех, у кого нет ВИЧ? 
ВИЧ и СПИД не синонимы. СПИД – понятие более широкое и означает дефицит иммунитета. Такое состояние может возникнуть в результате самых различных причин: при хронических истощающих заболеваниях, воздействии лучевой энергии, у детей с дефектами иммунной системы и у больных старческого возраста с инволюцией иммунной защиты, некоторых медикаментозных и гормональных препаратов. ВИЧ-инфекция - прогрессирующее антропонозное инфекционное заболевание, с кровоконтактным механизмом заражения, характеризующееся специфическим поражением иммунной системы с развитием тяжелого иммунодефицита, который проявляется вторичными инфекциями, злокачественными новообразованиями и аутоиммунными процессами.
Болезнь передается при половых контактах, особенно гомосексуальных; от инфицированной матери к ребенку в период беременности через плаценту, во время родов, при грудном вскармливании от матери к плоду; через бритвенные приборы и другие колюще-режущие предметы, зубные щетки и т. п. Эпидемиологи ВИЧ не допускают существования воздушно-капельного и фекально-орального путей передачи, так как выделение ВИЧ с мокротой, мочой и калом весьма незначительно, а также незначительно и число восприимчивых клеток в желудочно-кишечном тракте и дыхательных путях.

30 апр. 2010 г. в 22:32
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
Без выделения возбудителя в чистом виде постулаты Коха не выполняются и ВИЧ нельзя считать заболеванием инфекционной этиологии. 
Цитата (википедия):
1. Микроорганизм постоянно встречается в организме больных людей (или животных) и отсутствует у здоровых;
2. Микроорганизм должен быть изолирован от больного человека или животного и его штамм должен быть выращен в чистой культуре;
3. При заражении чистой культурой микроорганизма здоровый человек (или животное) заболевает;
4. Микроорганизм должен быть повторно изолирован от экспериментально заражённого животного или человека.
Первые три постулата известны также под названием триады Коха. Следует заметить, что Кох полностью изъял вторую часть первого постулата, обнаружив бессимптомных носителей холеры (Koch, 1893) и, позже, тифа. Второй постулат не всегда удается реализовать для доказательства патогенной природы микроорганизма, так как все вирусы и некоторые бактерии (например. возбудители проказы) не могут быть получены в чистой культуре на искусственной питательной среде.
Третий постулат не всегда имеет место, как это обнаружил сам Кох для туберкулёза и для холеры (Koch, 1884). Нередко у части индивидов подверженного инфекционному заболеванию вида существует врожденная или приобретенная невосприимчивость, связанная с иммунным статусом или особенностями генотипа. Например, люди с делецией части гена CCR5 (гомозиготы по аллелю CCR5 Δ32) не заражаются ВИЧ-инфекцией, натуральной оспой и чумой.
Говоря проще, есть куча заболеваний, официально признанных, не подходящих под постулаты Коха.

30 апр. 2010 г. в 22:34
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Тест на антитела совершенно не специфичен. Зафиксировано около 60 различных факторов влияющих на результаты тестов. 
Подтверждение – Журнал Континуум, созданный с целью ознакомления медицинской общественности с альтернативными мнениями, в своих материалах представил список факторов, вызывающих ошибочные положительные результаты теста на ВИЧ-антитела. (Сентябрь,1996, Зенгерс, Калифорния) Описанный перечень не достоверен, ибо ни одно из состояний НЕ ГАРАНТИРУЕТ положительного результата ИФА, а значит, не может являться показателем, что оно действительно является приличной ложноположительного результата.

30 апр. 2010 г. в 22:36
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Более чем за 6 лет наблюдений за парами не было зафиксировано ни одного случая передачи ВИЧ от позитивного партнёра к отрицательному. В качестве подтверждения - выдержка из исследования Нэнси Падиан. *We followed 175 HIV-discordant couples over time, for a total of approximately 282 couple-years of follow-up...The longest duration of follow-up was 12 visits (6 years). We observed no seroconversions after entry into the study...only 75% reported consistent condom use in the 6 months prior to their final follow-up visit. Forty-seven couples who remained in follow-up for 3 months to 6 years used condoms intermittently, and no seroconversions occurred among exposed partners.* Padian NS et al. Heterosexual Transmission of Human Immunodeficiency Virus (HIV) in Northern California: Results from a Ten-Year Study. Am J Epidemiol. 1997 Aug;146(4):350-7
Смысл содержания: Наблюдения за 175 парами, 75% из которых использовали презерватив нерегулярно, а 25% не использовали совсем, не показало установленных случаев заражения отрицательного партнера.

Во-первых, сама Нэнси Падиан откомментировала свои исследования так:
 HIV is unquestionably transmitted through heterosexual intercourse.   Indeed, heterosexual intercourse is now responsible for 70-80% of all HIV transmissions worldwide (2). The current likelihood of male to female infection after a single exposure to HIV is 0.01-0.32% (2, 3), and the current likelihood of female to male infection after a single exposure is 0.01-0.1% (2). In short, the evidence for the sexual transmission of HIV is well documented, conclusive, and based on the standard, uncontroversial methods and practices of medical science. Individuals who cite the 1997 Padian et al. publication (1) or data from other studies by our research group in an attempt to substantiate the myth that HIV is not transmitted sexually are ill informed, at best. Their misuse of these results is misleading, irresponsible, and potentially injurious to the public.
Полный текст тут:
http://aidstruth.org/denialism/misuse/padian
Смысл высказывания: множеством исследований зарегистрирована передача половым путем и вышеприведенное исследование нельзя считать нерушимым доказательством отсутствия половой передачи ВИЧ, а все, кто использует эти данные в таком ключе - нехорошие люди.
Во-вторых, альтернативные данные:
КЛИНИКО-ИММУНОЛОГИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА КОГОРТЫ ВИЧ-ИНФИЦИРОВАННЫХ И ГРУПП РИСКА ЗАРАЖЕНИЯ ВИЧ
Работа выполнена в Федеральном государственном бюджетном учреждении «Государственный научный центр «Институт иммунологии» Федерального медико-биологического агентства и Государственном учреждении здравоохранения Московской области Московском областном центре по профилактике и борьбе со СПИДом и инфекционными заболеваниями
Среди 1711 обследованных гетеросексуальных половых партнеров ВИЧ-инфицированных ВИЧ-инфекция была выявлена у 300, показатель заболеваемости составил 17,5%. При этом из 708 обследованных партнеров ВИЧ-инфицированных по совместному употреблению инъекционных наркотиков, ВИЧ-инфекция была выявлена у 88, показатель заболеваемости составил 12,4%. Это подтверждает, что половые контакты являются существенным фактором распространения ВИЧ-инфекции в Московской области.
С развитием эпидемии ВИЧ-инфекции появляется все большее число дискордантных пар, в которых один из половых партнеров является ВИЧ-позитивным. Это позволило идентифицировать и наблюдать в течение 2 лет 329 дискордантных пар, имеющих стабильные отношения. За период наблюдения в данной группе выявлен 21 случай инфицирования ВИЧ, показатель заболеваемости составил 6,4%.
Выявлен более низкий показатель заболеваемости ВИЧ-инфекцией в дискордантных парах (постоянные партнеры) в сравнении с гетеросексуальными половыми партнерами ВИЧ-инфицированных (постоянные и случайные) Одно из наиболее вероятных объяснений состоит в том, что ВИЧ-отрицательный партнер в дискордантной паре информирован о ВИЧ-позитивности другого партнера, что способствует использованию им средств защиты
Полный текст нетрудно найти в сети.
Еще можно почитать тут:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2748905/

30 апр. 2010 г. в 23:06
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 А как можно заразиться ВИЧ, если он не может ни покинуть клетку, ни проникнуть в клетку, ни воспроизвести самого себя? 
Есть определенный механизм проникновения вируса. В двух словах и весьма примерно (дабы не давать ссылок на специализированную литературу).
Вирус - это цепочка наследственной информации, заключенная в белково-липидную капсулу. На поверхности этой капсулы имеются определенные белки. При попадании вириона, этого единичного вируса, в кровоток, он прикрепляется к клеткам, имеющим на своей поверхности определенные рецепторы (те самые CD4). Далее вступают в дело ферменты, позволяющие вирусу ввести свою наследственную информацию на цепочка РНК внутрь клетки. С помощью ферментов транскриптаза (ревертаза), рестриктаза, протеаза и прочих вирусная информация воспроизводится внутри клетки. Ни для кого не секрет, что все клетки организма внутри себя вырабатывают определенные вещества, так вот иммунные клетки начинают, сами того не желая, воспроизводить новые вирионы, и производят их вплоть до гибели клетки.

1 мая 2010 г. в 02:28
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 ВААРТ - это химия, которая убивает человека быстрее, чем любая существующая болезнь. 
http://www.natap.org/2006/HIV/011906_01.htm
Думаю, исследование тут переводить не имеет смысла. Хотя, если кому-то будет интересно, могу заняться. Кратенько – исследование показывает увеличение продолжительности жизни и снижение смертности от различных причин на АРВТ.

1 мая 2010 г. в 02:29
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Откуда взяли данные о том, какие белки входят в ВИЧ? 
Во-первых, прочитан геном вируса, поэтому известны последовательности генов, входящих в состав вирусного генома, а значит и аминокислотная последовательность вирусных белков.
Во-вторых, есть более сложные, но действующие методы прямого чтения аминокислотных последовательностей, одним из которых является масс спектрометрия.
В-третьих, есть рентген-структурный анализ, позволяющий определить структуру белков. Чтобы подсмотреть структуры белков вируса ВИЧ, можно зайти в базу данных pdb.
В-четвертых, гены всех белков ВИЧ так или иначе были клонированы, а функции белков неоднократно исследовались в экспериментальных условиях. Т.е. мы не только знаем, какие белки входят в состав ВИЧ, но и ряд их функций.

1 мая 2010 г. в 02:30
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Почему, несмотря на огромные финансовые вливания ученые не продвинулись в своей теории ни на шаг? 
Ответ с форума Первого канала.
Это ложное утверждение. Первые антиретровирусные препараты продлевали время до наступления СПИД всего на пару лет. Современные средства терапии позволяют отсрочить появление СПИД у ВИЧ+ людей на десятки лет. Это довольно серьезное продвижение. Так же установлен механизм проникновения вируса в клетки, в частном случае, роль рецепторов к цитокинам на поверхности лимфоцитов, с которыми вирус связывается. Есть первый случай полного выздоровления ВИЧ+ больного в германии. К сожалению, примененная процедура лечения сама по себе очень опасна и сложна, поэтому утверждать, что лекарство найдено – нельзя. Больному раком в ВИЧ сделали пересадку костного мозга, а донором взяли человека с мутацией CCR5_delta_32, защищающей лимфоциты от ВИЧ. Есть все основания полагать, что этот человек вылечился и от рака и от ВИЧ.

1 мая 2010 г. в 02:36
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Где можно увидеть документы или доказательства тому, что ВИЧ вызывает СПИД?
Например, на шимпанзе проводили опыты и показали, что заражение определенными штаммами ВИЧ (не все штаммы ВИЧ-1 человека патогенны для шимпанзе) вызывают гибель лимфоцитов. Вот одна из относительно ранних работ в этой области.
Loss of CD4+ T Cells in Human Immunodeficiency Virus Type 1-Infected Chimpanzees Is Associated with Increased Lymphocyte Apoptosis
Ian C. Davis,1 Marc Girard,2 and Patricia N. Fultz3. J Virol. 1998 June; 72(6): 4623–4632.


1 мая 2010 г. в 02:40
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
Ну вот, то, что было приведено выше - это, скажем так, общепопулярные вещи, которые я готова перевести и выложить полным текстом, если кому-то это действительно нужно.
Ниже будут несколько чисто научных постов. Так как я в этом ничего не понимаю (по крайней мере, пока), то занимаюсь копипастом. Лично мне было интересно узнать всё нижеприведенное, надеюсь, что не только мне.

1 мая 2010 г. в 02:45
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Какой метод дает точный ответ о наличии ВИЧ?
Меньше всего ложноположительных результатов даст метод, сочетающий выделение РНК из крови, обратную транскрипцию РНК в ДНК, ПЦР с использованием полученной ДНК в качестве матрицы и последующее клонированием, плюс чтение образца на секвенаторе. Если описывать подробнее, то это выглядит так. ВИЧ имеет геном, представляющий из себя двойную цепочку РНК. Выделяем РНК из крови пациента, РНК превращаем в ДНК с помощью фермента «обртаной транскриптазы» (кстати, у ВИЧ есть такой фермент), ДНК размножаем в пробирке (ПЦР), вставляем в вектор (бактериальную плазмиду), размножаем вектор в культуре бактерий, выделяем вектор со вставкой, читаем последовательность вставки (пару сотен нуклеотидов) и мы точно знаем не только есть ли ВИЧ в крови, но и всевозможные детали, вроде штамма вируса, наличие мутаций в его геноме и т.д. Такая процедура занимает довольно много времени и относительно дорога, поэтому массово не используется. Но если пациент захочет такую процедуру то, как говорится, всегда пожалуйста.
В целом есть серия довольно надежных методов, обладающих высокой специфичностью и чувствительностью (~99%). Можно проверить наличие антител к белкам вирусной оболочки. Можно сделать просто ПЦР, без секвенирования.

1 мая 2010 г. в 02:46
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Есть вероятность, что ПЦР-тест находит собственные человеческие ретротранспозоны.
Transposons are mobile genetic elements that can multiply in the genome using a variety of mechanisms. Retrotransposons replicate through reverse transcription of their RNA and integration of the resulting cDNA into another locus. This mechanism of replication is shared with retroviruses, with the difference that retrotransposons do not form infectious particles that leave the cell to infect other cells. The long terminal repeat (LTR) retrotransposons, one of the main groups of retroelements (which include both LTR and non-LTR retrotransposons as well as retroviruses), are among the most abundant constituents of eukaryotic genomes. The LTRs are the direct sequence repeats that flank the internal coding region, which - in all autonomous (functional) LTR retrotransposons - includes genes encoding both structural and enzymatic proteins. The gag gene encodes structural proteins that form the virus-like particle (VLP), inside which reverse transcription takes place.
genomebiology.com/2004/5/6/225
 

Для тех, кто не знает, что такое ретротранспозоны: http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%A0%D0%9D%D0%9A-%D1%82%D1%80%D0%B0%D0%BD%D1%81%D0%BF%D0%BE%D0%B7%D0%BE%D0%BD%D1%8B
Если совсем грубо – это элементы ДНК, способные перемещаться, встраиваться и самовоспроизводиться.
Ответ с форума.
И Вы сами же процитировали очень интересную вещь, которая стоит выделения:
This mechanism of replication is shared with retroviruses, with the difference that retrotransposons do not form infectious particles that leave the cell to infect other cells.
Ретротранспозоны НЕ ФОРМИРУЮТ инфекционных частиц, заражающих другие клетки. Они в принципе не покидают клеток. В микроскоп мы видим вирионы ВИЧ, покинувшие клетки. Их нельзя спутать с ретротранспозонами.

1 мая 2010 г. в 02:47
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Каким образом геном вируса отделили от хозяйского генома и доказали, что это разные сущности? 
Nature. 1985 Jan 24-30;313(6000):277-84. Complete nucleotide sequence of the AIDS virus, HTLV-III. Ratner L, Haseltine W, Patarca R, Livak KJ, Starcich B, Josephs SF, Doran ER, Rafalski JA, Whitehorn EA, Baumeister K, et al.

1 мая 2010 г. в 02:48
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
 Например, белок p24, считающийся специфичным для ВИЧ, используют как маркер в диагностике рака молочной железы.
Интересно, а с чего Вы взяли, что у протеина злокачественных клеток молочной железы и капсидного белка ВИЧ есть что-то общее, кроме молекулярной массы 24 кДа? Или два человека с одинаковым весом для Вас - это одно и тоже?
p24 - белок массой 24 кДа. Вот и все. Любой белок массой 24 кДа может так называться. Это не таксономическое название.
ВИЧ имеет HIV Gag p24.

1 мая 2010 г. в 02:50
На сайте с
12-08-2009

Пол
Женский
При ПЦР обнаруживают определенные нуклеотидные последовательности (например, env или gag), почему-то считающиеся специфическими для ВИЧ, хотя это вовсе не так. Последовательности env и gag имеется в человеческих ретротранспозонах, т.е. в нашем собственном геноме. Осмелюсь утверждать, что отличить наш собственный gag от вирусного невозможно.
gag бывают разные. ВИЧ-1 имеет геном из более 9500 нуклеотидов, это уникальная последовательность. Известно, что она присутствует в качестве одного фрагмента.
Итак, берем последовательность gag ВИЧ-1 человека, выделенный в России (это не важно откуда, т.к. разница не большая).
Вот эта последовательность. Тут так же указаны все индификаторы, чтобы любой мог проверить, что это та самая последовательность, что я не написал ее из головы.
gi|294992893|gb|GU991883.1| HIV-1 isolate Pat22 from Russia gag protein (gag) gene, complete cds; and pol protein (pol) gene, partial cds
ATGGGTGCGAGAGCGTCAGTATTAAGCGGGGGAAAATTAGCCAAATGGGAGAAAATTCGGTTGNGGCCAG
GAGGAAGAAACCAATATAAAATGAAACATTTAGTATGGGCAAGCAGGGAGATGGAGAGATTTGCACTTAA
CCCTGGCCTTATGGAAACAGCAGAAGGTTGTCAACAAATAATGGTACAGATACAACCAGCTCTCAAGACA
GGAACAGAGGAGCTTAGATCATTATATAATACAATAGCAGTTCTCTATTGTGTACACCAAAGGATAGAGA
TAAAAGACACCAAAGAAGCTCTAGAGGAAATAGAAAAGCTACAAAAGAAAAGTCAGCAAAAAACACAGCA
GGCAGCAACAGATACAGGAAACAGTAGCCAAGTCAGCCAAAATTATCCTATAGTGCAGAATGCACAAGGG
CAAATGGTACACCAGGCCATATCACCTAGGACCTTGAATGCATGGGTAAAAGTAGTAGAAGAAAAGTCCT
TTAGCCCAGAAGTAATACCCATGTTTTCAGCATTATCAGAAGGAGCCACCCCACAGGATTTGAATACCAT
GCTAAACACAGTGGGGGGGCATCAAGCAGCTATGCAGATGCTAAAGGAGGCTATCAATGATGAAGCTGCA
GAGTGGGACAGGTTACACCCACCACAGGCAGGGCCTATTGCGCCAGGCCAGATAAGAGAACCAAGGGGAA
GTGATATAGCAGGAGCTACTAGTACCCTGCAGGAGCAAATAACATGGATGACCAGCAACCCACCTATCCC
AGTGGGAGAAATTTATAAAAGATGGATAATCTTGGGATTAAATAGAATAGTAAGAATGTATAGCCCTGTC
AGCATTTTAGACATAAGACAAGGGCCAAAAGAACCCTTTAGAGATTATGTAGATAGGTTCTTTAAAACTT
TAAGAGCTGAGCAAGCTACACAGGAAGTAAAAAGCTGGATGACAGACACCTTGTTGRTCCAAAATGCGAA
CCCAGATTGTAAGAACATCTTAAGAGCATTAGGACCAGGAGCTTCACTAGAAGAAATGATGACAGCATGT
CAGGGAGTGGGAGGACCCAGCCATAAAGCAAGAGTTTTAGCTGAAGCAATGAGCCAGGCATCAGGTGCCG
CAGCGGCCATAATGATGCAGAAAAGCAATTTTAAGGGCCCAAGAAGAGCTATTAAGTGTTTCAACTGTGG
CAAGGATGGACATATAGCCAGAAATTGCAGGGCCCCTAGAAAGAAGGGCTGTTGGAAATGTGGAAAGGAG
GGACATCAAATGAAAGATTGCACRGAGAGCAAGGCTCATTTTTTAGGGAAAATCTGGCCCTCCAGCAGGG
AGAGGCCAGGGAATTTTCTTCAGAACAGGACAGAGCCAACAGCCCCACCAGCAGAGAGCTTCGGGGAGGA
GATAGCCCCTGCCCCGAAACAGGAGCCGAAGAAGGAGGAGCTATATCCCTTAGCCTCCCTCAAATCACTC
TTTGGCAGCGACCCYTAGTCTCAGTAAGAGTRGGGGGACAGCTAATAGAAGCYCTATTAGACACAGGAGC
AGATGATACAGTATTAGAAGACATAAATTTACCAGGAAAATGGAARCCAAAAATGATAGGGGGAATTGGA
GGTTTTATCAAAGTAAGACAGTATGATCAAATACTTATAGAAATTTGTGGAAAAAAGGCTATAGGGACAG
TATTAGTAGGACCTACACCTATCAACATAATTGGGAGAAATATGTTGACTCAGATTGGYTGTACTTTAAA
TTTTCCAATTAGTCCTATTGAAACTGTACCAGTAAMATTAAAGCCAGGAATGGATGGGCCAAAGATCAAA
CAATGGCCATTGACAGAAGAGAAAATAAAAGCATTAATAGAAATTTGTACAGAAATGGAAAAGGAAGGAA
AAATTTCAAAAATTGGGCCTGAAAATCCATACAACACTCCAATATTTGCTATAAAGAAAAAAGACAGTAC
TAAATGGAGAAAATTAGTAGATTTCAGAGAGCTCAATAAAAGAACTCAAGACTTCTGGGAGGTACAATTA
GGAATACCTCACCCAGCAGGGTTAAAACAGAAAAAATCAGTAACAGTACTAGATGTGGGGGATGCATATT
TTTCAGTTCCATTAGATGAAAGCTTTAGAAAGTATACTGCATTCACTATACCTAGTATAAATAATGARAC
ACCAGGAATTAGATATCAGTACAATGTGCTTCCACAGGGATGGAAAGGATCACCAGCAATATTCCAAAGT
AGCATGACAAAAATCTTAGAGCCCTTTAGAAARAGAAAYCCAGAAATGGTGATCTACCAATACATGGATG
ATTTATATGTGGGATCTGACTTAGAATTAGGACAACATAGAGCAAAAATAGAAGAGTTAAGAGAGCATTT
ACTGARATGGGGATTTACCACACCAGATAARAARCATCAGAAAGAACCTCCATTCTTRTGGATGGGATAT
GAGCTCCATCCTGACAARTGGACGGTACAACCTATACAGTTGCCAGATAAAGARAGCTGGACTGTCAATG
ATATACAAAAGCTAGTGGGAAAACTAAATTGGGCAAGTCAGATTTATCCAGGAATTAGAATAAGGCAACT
ATGTAAACTCATTAGGGGGGCTAAAGCACTAACAGACATAGTACCACTAACARAAGAAGCAGAGCTAGCA
CTA
Итак, кидаем эту последовательность в программ BLast против генома человека. Программа Blast ищет похожие последовательности. Это стандартная программ для поиска гомологичных (т.е. похожих) генетических последовательностей.
Вывожу результат работы программы:
Description
human build 37 genome database (reference GRCh37 and alternate assemblies) Program
BLASTN 2.2.23+
No significant similarity found.
Это означает, что в геноме человека, ни в одной известной сборке, такого гена нет. Даже близко нет, потому что даже если бы он был хоть чуть-чуть родственным, он бы нашелся. Более того, этого гена нет ни в одном известном геноме млекопитающего. Я это тоже проверил. Зато против вирусных последовательностей находится прекрасно. Кстати, этот фрагмент взят из генома вируса ВЫДЕЛЕННОГО в России ВИЧ-1. Вот работа
Knops,E., Daeumer,M., Awerkiew,S., Kartashev,V., Schuelter,E., Kutsev,S., Brakier-Gingras,L., Kaiser,R., Pfister,H. and Verheyen,J.
Evolution of PI resistance in the gag and pol gene of HIV subtype G isolates (работы сделана в Institute of Virology, University of Cologne )
Это воспроизводимая процедура, которую может проделать любой и убедиться, что товарищи Вам наглым образом соврали. Последовательности gag вируса иммунодефицита человека в геноме человека не обнаружено.
Где его можно обнаружить, так это в ДНК лимфоцита ВИЧ инфицированного. Ну может еще в паре типов клеток, у которых эксперссированы нужные рецепторы цитокинов и CD4. Все-таки это ретровирус и он может по определению выстроиться в геном, чтобы размножаться.
Если речь идет о других вирусных изолятах, то данный изолят российского вируса похож больше всего на изолят вируса из кубы
HIV-1 isolate Cu87 from Cuba, complete genome.
Это вирус был изолирован в 2007 в ходе следующей работы:
J Acquir Immune Defic Syndr. 2007 Jun 1;45(2):151-60.
Identification of 3 phylogenetically related HIV-1 BG intersubtype circulating recombinant forms in Cuba.
Sierra M, Thomson MM, Posada D, Pérez L, Aragonés C, González Z, Pérez J, Casado G, Nájera R.
Желающие могут использовать Blast указанной последовательности и ознакомиться с несколькими тысячами прочитанных генов других изолированных вирусов ВИЧ, посмотреть, чем они отличаются и так далее.
Если мы можем отличить ВИЧ кубинский от ВИЧ русского, неужели кто-то думает, что мы не отличим ВИЧ от гена человека?

1 мая 2010 г. в 02:51
На сайте с
15-03-2008

Пол
Мужской
angry_alien, низкий поклон за тему.

3 мая 2010 г. в 16:17
На сайте с
8-01-2009

Пол
Мужской

Долго полз сюда...все откладывал
Ты умничка и я тобой горжусь!
Вот

4 мая 2010 г. в 04:24
На сайте с
12-05-2009

Пол
Женский
Да тема просто шикарная, реально теперь только в эту тему буду людей гнать за шкирку!!!!
А то больно много их последнее время
angry_alien спасибо за труд, он огромен и очень важен!

4 мая 2010 г. в 13:33
На сайте с
12-05-2009

Пол
Женский
Цитата
Диссиденты только боюсь не осилят уже первый параграф.   

Они двух слов то связать не могут, куда уж им читать такие статьи....Эх и почему мне везет на такие экземпляры вечно. Диссидента сюда фиг затащить, они ж как роботы, только свою лабуду и могут чирикать. А читать то им лень

5 мая 2010 г. в 01:13
На сайте с
5-10-2009

Пол
Женский
Круто спасибо!!!! А про то что не осилят-верно подмечанно!!!!!

10 мая 2010 г. в 11:31
На сайте с
7-09-2009

Пол
Женский
умница ты наша видели мы, как ты их там.... ух!!! только у меня теперь на мэйле 100 писем, что они тебя там в личке атакуют, прошу прощения за флуд

13 мая 2010 г. в 03:52
На сайте с
19-02-2010

Пол
Мужской
труд колосальный конечно! тока для чего????? опять кто владеет информацией владеет миром!Ты эти труды сама составила? на основании собственных исследований7 если просто октапировала то им цена рупь ведро в базарный день! Всё это трёп и варка воды!

20 мая 2010 г. в 14:01
Цитировать
Ваше сообщение