Проект EuResist prediction engine

Прогностическая система EuResist — мощный инструмент, предсказывающий на основании анализа большого массива накопленных данных, вероятность успеха антиретровирусной терпии. EuResist обеспечивает оценку эффективности применения комбинаций антиретровирусных препаратов, основанную на анализе клинических документов более чем 48000 ВИЧ-инфицированных пациентов в Европе.

Прогнозирование ответа основывается как на данных секвенирования в формате FASTA (текстовое содержимое файла .fa или .fasta, полученное из лаборатории), так и учитывает предыдущую терапию, вирусную нагрузку, уровень CD4+ клеток, пол, возраст и путь инфицирования. Имеется возможность выбора доступных для терапии перепаратов.

Система может быть использована специалистами в качестве дополнительного инструмента в выбора лечения. Внутренняя валидация системы продемонстрировала прогностическую точность, равную 77-78% (площадь под кривой, ППК) (66-69% среди НОП) при условии, что терапевтический успех определяли как снижение вирусной нагрузки (ВН) не менее чем на 2 log, либо, как недетектируемую ВН через 8 недель после начала лечения.
http://arvt.ru/related.html